系统生物学不再将生命视为孤立零件的堆砌,而是试图理解细胞内无数分子如何像交响乐般协同运作。这一领域通过整合海量数据,揭示基因、蛋白质与环境之间复杂的互动网络,让我们从整体视角去解读生命的奥秘,而非仅仅关注单一环节。

在 Gist.Science 上,我们持续追踪并处理来自 bioRxiv 的最新预印本,确保您能第一时间接触到这些前沿探索。每一篇入选的系统生物学论文,都经过我们团队的深度解读,提供通俗易懂的科普摘要与详尽的技术解析,让专业研究变得触手可及。

下方为您呈现该领域最新的预印本列表,带您走进从数据到生命图景的精彩旅程。

📄 systems biology

Modeling and Tracking of Heterogeneous Cell Populations via Open Multi-Agent Systems

本文提出了一种基于开放多智能体系统和扩展卡尔曼滤波的增强型细胞追踪算法,通过建模与参数识别有效解决了肿瘤细胞与间充质基质细胞共培养体系中异质细胞群体的动态变化、相互作用及谱系追踪难题,并在性能上优于现有方法。

Tramaloni, A., Testa, A., Avnet, S., Massari, S., Di Pompo, G., Baldini, N., Notarstefano, G.2026-02-18
📄 systems biology

Spatial Rewiring of Enterocyte Identity in Celiac Disease

该研究利用空间和单细胞转录组学技术揭示,乳糜泻患者小肠绒毛变短导致 BMP 和 WNT 信号产生细胞间距缩短及形态发生素场重叠,进而引发肠上皮细胞出现多区域程序共表达的新身份以及胃窦样细胞化生,从而阐明了该疾病中上皮重塑的细胞机制。

Barkai, T., Frieman-Sharabi, R., Bahar Halpern, K., Novoselsky, R., Korem Kohanim, Y., Shir, S., Golani, O., Goliand, I. (…)2026-02-17
📄 systems biology

Cell cycle-dependent protein dynamics in budding yeast resolved by deconvolution of bulk proteomics

该研究开发了一种基于酵母种群模型的计算去卷积方法,成功从同步化不完善的酿酒酵母群体蛋白质组数据中解析出 563 种具有细胞周期依赖性动态的蛋白质,揭示了细胞周期中代谢活动的显著波动并构建了关键资源。

Zylstra, A. J., Rovetta, M., Vedelaar, S., Bleischwitz, C., Fülleborn, J. A., van Oppen, Y. B., Markus, H. P., Korbeld (…)2026-02-13
📄 systems biology

Emergent Threshold Dynamics in Unified Metabolic-Regulatory Models: Achieving Spontaneous Homeostasis Through Bidirectional ATP-Pathway Coupling

本文引入了信号层级 Petri 网(Signal Hierarchical Petri Nets),这是一种通过将代谢状态(ATP 水平)与调节控制进行双向耦合,从而实现涌现阈值动力学和自发稳态的新型计算形式化方法,使得在无需显式编程的情况下,能够实现对通路切换和组织特异性药物积累等适应性细胞行为的计算机模拟重现。

Simao, E.2026-02-09
📄 systems biology

Activities of aqueous extract of Tamarindus indica on phenylhydrazine-induced hematopathological changes in anemic male wistar rats

本研究表明,罗望子(*Tamarindus indica*)果肉的水提取物能有效刺激造血作用,并通过逆转包括红细胞形态畸变、血清乳酸脱氢酶(LDH)升高以及骨髓退行性变在内的血液病理学变化,显著改善苯肼诱导的溶血性贫血,实验对象为雄性Wistar大鼠。

Dare, S. S., Stephen, C. P., Mario, E. F.2026-02-02